琼脂糖主要用于核酸分析检测用凝胶。琼脂糖在水中一般加热到90℃以上溶解,温度下降到35-40℃时形成良好的半固体状的凝胶,这是它具有多种用途的主要特征和基础。
在挑选琼脂糖,我们往往只是关注能不能跑出结果,而忽略了产品微小差异带来的结果偏差。在实验中,如何挑选一款好用的琼脂糖时,以下的几个指标可以重点关注;琼脂糖强度:琼脂糖凝胶性能通常用凝胶强度表示。强度越高,凝胶性能越好。质量较好的琼脂糖强度通常在1200克/cm2以上(1%胶浓度)。
低电渗:在琼脂糖制备过程中需要把琼脂果胶尽量去除,否则琼脂糖有可能存在极微量硫酸根和丙酮酸取代电离基团,就会造成电内渗(EEO),电内渗对质点的移动产生影响。
低硫酸根:质量较好的琼脂糖硫酸根含量比较低,通常在0.2%以下。将负电性基团减少到最低限度,这种基团的作用包括增加电内渗作用,以及增加带电物质的固定,例如增加蛋白质的非选择性固定。负电基团与琼脂果糖的不良分离也可能导致增加的负电基团的存在。